Thunderbird verschlüsselt deine E-Mails nicht automatisch. Hier gibt es eine Anleitung von Security In A Box für die E-Mail-Verschlüsselung mit Mozilla Thunderbird, GNU Privacy Guard (GPG) und Enigmail.

Thunderbird kann optinal mit dem Tor-Netzwerk über das Addon TorBirdy verbunden werden.

Auch wenn Thunderbird als Chat- und IRC-Client verwendet werden kann, bietet es dafür keine Verschlüssleung der Chat-Nachrichten.